大理研究院成立于2010年6月，是由华中师范大学、大理大学和大理市人民政府“两校一市”联合共建的多学科交叉的科研机构。其前身为华中师范大学大理研究院，2016年3月更名为大理大学大理研究院。
2016年以来，经华中师大、大理大学和大理市政府三方的共同努力，联合共建大理研究院工作进展顺利，取得了“洱海水专项研究”等一批科研成果。
研究院以“研究大理问题、服务大理发展”为宗旨，本着“突出重点、整合资源、集聚人才、强化组织、服务地方”的思路，立足大理经济社会发展需要，发挥学科综合优势，提升科、研究水平，增强成果转化能力，充分发挥服务大理经济社会发展的职能作用。
研究院的主要任务是：
（一）科学研究。围绕大理经济社会发展需要，组织跨学科研究人员，承担重大多学科研究任务，合作研究大理市委托的重大研究项目，鼓励和支持科研人员发表高水平学术论文，出版高质量学术专著，获得重大科研成果奖励。
（二）决策咨询。以研究院为平台，协调有关单位（部门），开展调查研究，为大理经济社会发展的重大问题，提供决策咨询服务。
（三）成果转化。以研究院为“孵化器”，加强与地方政府、企事业单位的合作，实行产学研相结合，形成强大的研究、开发、生产一体化，促进科技成果转化为生产力。
（四）学科建设。开展重点学科和特色学科建设，创建良好的多学科研究条件，形成多学科研究氛围，建立跨学科交流机制，建设有自身特色的重点学科。
（五）人才培养。以研究院为平台，全面提高硕士生导师水平，与华中师范大学开展联合培养研究生工作。
研究院实行理事会领导下的院长负责制。理事会由华中师范大学、大理大学和大理市人民政府共同组成。其主要职责是：研究决定研究院的发展战略和重大事项。研究院下设办公室，负责研究院的日常工作。其主要职责是：负责研究院的项目、财务、资产、秘书、档案、考核等管理工作。
研究院成立专家委员会，由华中师范大学、大理大学和大理市人民政府选派有关专家组成。其主要职责是：参与讨论研究院的发展战略，对项目组的组建、研究团队的准入、研究项目的立项等进行论证，对项目研究中的重大事宜，组织调研并提出咨询建议。
从2016年起，由华中师大、大理大学和大理市政府三方共同筹措科研经费，设立“大理研究院课题”，围绕大理经济社会发展重大问题开展研究工作。
“十三五”期间，研究院将紧扣国家发展战略，围绕大理“民族团结进步示范区”、“生态文明建设排头兵”、“面向南亚东南亚辐射中心”的发展目标，聚焦民族、发展、治理、生态、医药、文化等六大研究方向，使研究院成为省内外有重要影响的研究机构。
