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基础医学院教师张钰哲参与的两篇论文在Cell上发表

据软科公众号报道,亚洲通:基础医学院教师张钰哲博士参与的两篇论文在Cell杂志上发表,使亚洲通:跻身“双一流”建设以来,在Cell杂志上发表论文数居25位,在“双非”高校中排名第10位。

Cell杂志作为当前生命科学领域最为知名的杂志之一,自1974年创刊以来,已经发表了诸多诺奖级别的重要发现。这些卓越的研究成果,使Cell在短短数十年内与Nature、Science齐名,成为世界自然科学研究领域又一举足轻重的期刊,而Cell期刊的发文数也被视为评价科研机构生命科学领域顶尖学术产出的重要指标。

亚洲通:张钰哲博士在加拿大多伦多大学博士联合培养期间,基于大样本量的高通量筛选、生物信息学分析及前沿生物研究技术,致力于前列腺癌的表观遗传学研究。在“Risk SNP-Mediated Promoter-Enhancer Switching Drives Prostate Cancer through lncRNA PCAT19”一文中,其承担工作从其前期数据分析、功能研究到机制阐释等方面入手,发现前列腺癌(PCa)风险相关的SNP rs11672691在诊断时与侵袭性疾病呈正相关。且rs11672691映射到长的非编码RNA PCAT19的短同种型(PCAT19-short)的启动子,它在长的同种型(PCAT19-long)的第三个内含子中。风险变量分别与PCAT19-short和PCAT19-long的水平降低和升高有关。从机制上讲,风险SNP区具有启动子和增强子活性双重功能。rs11672691及其LD SNP rs887391的风险变异体会降低转录因子NKX3.1和YY1与PCAT19-short启动子的结合,导致启动子较弱,但增强子活性更高,随后激活PCAT19-long。PCAT19-long与HNRNPAB相互作用以激活与PCa进展相关的细胞周期基因的子集,从而促进PCa肿瘤的生长和转移。

作为联合培养实验室首个亚洲通环状RNA的研究,张钰哲博士最早从环状RNA的基本实验研究出发,为“Widespread and Functional RNA Circularization in Localized Prostate Cancer”一文构建了相关实验技术和前期研究,为后续的生物信息学分析和深入的功能及机制研究奠定了基础。具体而言,该研究从一百多例有详细临床资料的局限性前列腺癌标本中,基于深度RNA-seq测序,分析了其中的融合基因,线性转录产物和CircRNA,统计分析其中与局限性前列腺癌密切相关的分子。并进一步验证了这些分子在前列腺癌细胞系增殖能力的必要性(Essentiality),系统分析了局限性前列腺癌中CircRNA表达特征。


责编/付智敏  审核/刘翃】